Harian Jogja diterbitkan perdana pada 20 Mei 2008, bersamaan dengan perayaan Seabad Hari Kebangkitan Nasional, oleh kelompok penerbit Bisnis Indonesia. Surat kabar ini menjadi koran komunitas ketiga dari grup Bisnis Indonesia setelah Solopos di Solo dan Monitor Depok di Depok, Jawa Barat. Harian Jogja dikemas untuk bisa dekat dengan karakter Jogja. Gaya penulisan, penggunaan tata warna, begitu dominan aspek lokal budaya Jogja. Menjadikan koran ini sebagai bagian Jogja, juga tercermin dari usul sapaan pembaca atas koran ini dengan panggilan Harjo (Mas harjo, Mbah Harjo, Pakde Harjo, Ki harjo). Sebuah nama sapaan khas setempat yang begitu akrab. Wilayah edar koran ada di seluruh wilayah Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta (Kota Jogja, Sleman, Bantul, Kulonprogo, Gunungkidul) dan sebagian wilayah Jawa Tengah antara lain Klaten, Kabupaten Magelang, Kota Magelang, dan Purworejo. Bersamaan dengan versi cetaknya, domain www.harianjogja.com pertama kali diluncurkan pada 20 Mei 2008.